Produktoj

Drug-induktita hepata vundo estas unu el la ĉefaj kaŭzoj de drogeluziĝo.La kapablo antaŭdiri la hepatajn efikojn de drogkandidatoj de iliaj kemiaj strukturoj estas kritika por helpi gvidi eksperimentajn drogeltrovajn projektojn al pli sekuraj medikamentoj.En ĉi tiu studo, ni kompilis datuman aron de 951 kunmetaĵoj raportitaj produkti larĝan gamon de efikoj en la hepato en malsamaj specioj, konsistante el homoj, ronĝuloj kaj neronĝuloj.La hepataj efikoj por ĉi tiu datumaro estis akiritaj kiel asertaj metadatenoj, generitaj de MEDLINE-abstraktaĵoj uzante unikan kombinaĵon de vortfaradaj kaj lingvaj metodoj kaj ontologiaj reguloj.Ni analizis ĉi tiun datuman aron uzante konvenciajn keminformatikajn alirojn kaj traktis plurajn demandojn rilatajn al transspecia konkordo de hepataj efikoj, kemiaj determinantoj de hepataj efikoj en homoj, kaj la antaŭdiro ĉu antaŭfiksita kunmetaĵo verŝajne kaŭzos hepatan efikon en homoj.Ni trovis ke la konkordo de hepataj efikoj estis relative malalta (ĉ. 39-44%) inter malsamaj specioj, levante la eblecon ke speciospecifeco povus dependi de specifaj trajtoj de kemia strukturo.Kunmetaĵoj estis grupigitaj per sia kemia simileco, kaj similaj kunmetaĵoj estis ekzamenitaj por la atendata simileco de siaj speci-dependaj hepataj efikoprofiloj.Plejofte, similaj profiloj estis observitaj por membroj de la sama areto, sed kelkaj kunmetaĵoj prezentiĝis kiel eksteruloj.La outliers estis la temo de fokusita aserta regenerado de MEDLINE same kiel aliaj datenfontoj.En kelkaj kazoj, kromaj biologiaj asertoj estis identigitaj, kiuj estis en linio kun atendoj bazitaj sur la kemiaj similecoj de kunmetaĵoj.La asertoj estis plue konvertitaj al binaraj komentarioj de subestaj kemiaĵoj (t.e., hepata efiko kontraŭ neniu hepata efiko), kaj binaraj kvantaj strukturo-aktiveca rilato (QSAR) modeloj estis generitaj por antaŭdiri ĉu kunmetaĵo estus atendita produkti hepatajn efikojn en homoj.Malgraŭ la ŝajna heterogeneco de datumoj, modeloj montris bonan prognozan potencon taksitan per eksteraj 5-oblaj krucvalidigaj proceduroj.La ekstera prognoza potenco de binaraj QSAR-modeloj estis plue konfirmita per ilia aplikiĝo al kunmetaĵoj kiuj estis prenitaj aŭ studitaj post kiam la modelo estis evoluigita.Laŭ nia scio, ĉi tiu estas la unua studo por kemia toksecprognozo kiu aplikis QSAR-modeladon kaj aliajn kiminformatikajn teknikojn al observaj datumoj generitaj per la rimedoj de aŭtomatigita tekstminado kun limigita mana kuracado, malfermante novajn ŝancojn por generi kaj modeligi kemian toksologion. datumoj.