Produktoj

Patogenaj molekulaj vojoj en cirozaj hepatmalsanoj kiel ekzemple hepatito C viruso (HCV), aŭtoimuna hepatito (AIH) kaj primara galcirozo (PBC) estas nebone karakterizitaj.Diference esprimitaj genoj ofte estas gravaj en malsanpatogenezo.Forigo subtrakta hibridigo (SSH) estas genar-kovranta aliro kiu riĉigas por diferencige esprimitaj mRNA-transskribaĵoj.Ni celis fari novajn observojn de diferenca gena esprimo en cirozo uzante SSH kombinitan kun kvanta realtempa inversa transkriptaza polimeraza ĉena reago (RT-PCR).Hepattranskriptomoj en HCV-cirozo, AIH-cirozo, PBC, kaj nemalsana hepata histo estis ekzamenitaj per SSH.Rezultaj komplementaj DNA (cDNA) klonoj estis reekranitaj por diferenciga esprimo per punkt-makulo hibridiĝo kaj tiam sekvencitaj.Elektita genekspresio estis kvantigita per realtempa RT-PCR.Sekvante SSH, 694 klonoj estis reekranitaj por diferenciga genekspresio, de kiuj 145 estis sekvencitaj kaj trovitaj veni de 89 malsamaj genoj.Sep klonoj estis homologaj nur kun esprimitaj sekvencetikedo (EST) sekvencoj ĉifrantaj genojn havantaj neniun konatan funkcion.Supren-reguligita esprimo de kvar genoj estis konfirmita per realtempa RT-PCR: transmembrano 4 superfamilia membro 3 (tetraspanin CO-029) en ĉiuj formoj de cirozo, erinaco interaganta proteino (HIP) en AIH-cirozo kaj kitinazo 3-simila-1 (HC gp-39 aŭ ykl-40) kaj ripeto de arginina-glutama acido (RERE) en HCV-cirozo.RERE-genpolimorfismoj kaj splisaj variaĵoj estis observitaj en ĉiuj ekzamenitaj histoj.Tetraspanin CO-029-suprenreguligo estis ĉefe lokalizita al galduktaj ĉeloj.En konkludo, novaj observaĵoj de diferenciga genesprimo en homa cirozo estis faritaj uzante SSH kiel la primaran eltrovilon.Aparte, pliaj studoj de la RERE-geno kaj ĝiaj produktoj en HCV rilata hepatmalsano estas garantiitaj.