Produktoj

Ni lastatempe raportis, ke pirennukleotido estas prefere enmetita kontraŭ abaza loko, la 3'-T de timindimero, kaj plej nedifektitaj bazoj per gista DNA-polimerazo eta (pol eta).Ĉar pireno estas nepolusa molekulo kun neniu H-liga kapablo, la nekutime altaj efikecoj de dPMP-enmeto estas atributitaj al sia supera baza stakiga kapablo, kaj substrekas la gravecon de bazstakado en la selektado de nukleotidoj de pol eta.Por esplori la rolon de H-ligado kaj bazpargeometrio en la elekto de nukleotidoj per pol eta, ni determinis la enmegajn efikecojn de la baz-modifitaj nukleotidoj 2,6-diaminopurino, 2-aminopurino, 6-kloropurino, kaj inozino kiu volus. faru malsaman nombron da H-ligoj kun la ŝablonbazo depende de bazpara geometrio.Watson-Crick-bazparigo ŝajnas ludi gravan rolon en la elekto de nukleotidaj analogoj por enmeto kontraŭ C kaj T kiel konstatite per la malkresko en la relativaj enmeta efikeco kun malkresko en la nombro da Watson-Crick H-obligacioj kaj pliiĝo en la nombro da interagoj donacanto-donacanto kaj akceptanto-akceptanto.La selektiveco de nukleotidinserto estas pli granda kontraŭ la 5'-T ol la 3'-T de la timindimero, en akordo kun antaŭa laboro sugestante ke la 5'-T estas tenita pli rigide ol la 3'-T.Krome, enmeto de A kontraŭ ambaŭ Ts de la dimero ŝajnas esti mediaciita per Watson-Crick-bazpariĝo kaj ne per Hoogsteen-bazpariĝo bazita sur la preskaŭ identaj enmeta efikecoj de A kaj 7-deaza-A, al ĉi-lasta el kiuj mankas H- liga kapablo ĉe N7.La relativaj efikecoj por enmeto de nukleotidoj kiuj povas formi Watson-Crick bazparojn paralelas tiujn por la Klenow-fragmento, dum la Klenow-fragmento pli forte diskriminacias kontraŭ misagordoj, en akordo kun sia pli granda formoselektiveco.Tiuj rezultoj substrekas la gravecon de H-ligado kaj Watson-Crick bazpargeometrio en la selektado de nukleotidoj de kaj pol eta kaj la Klen-ow-fragmento, kaj la pli malgrandan rolon de formselektado en enmeto de pol eta pro ĝia pli malferma kaj malpli. limigita aktiva retejo.